Obowiązek sprawozdawczy fundacji wobec ministerstwa stanowi istotny element nadzoru nad jej działalnością i zapewnienia przejrzystości funkcjonowania. Fundacje są zobowiązane do corocznego składania sprawozdań merytorycznych z prowadzonej działalności do odpowiedniego ministra nadzorującego, zgodnie z art. 12 ustawy o fundacjach (w przypadku Fundacji BT jest to Minister Kultury i Dziedzictwa Narodowego). Sprawozdanie merytoryczne powinno zawierać m.in. informacje o zrealizowanych celach statutowych, podejmowanych działaniach oraz źródłach finansowania.
Fundacja dotychczas złożyła następujące sprawozdania merytoryczne: